Основное направление музея гигиены - пропаганда медицинских и гигиенических знаний среди населения, предупреждения заболеваний, достижение современной медицины, анатомия и физиология человека. Основные экспонаты музея посвящены личной гигиене, а так же профилактике многих заболеваний. Стены залов увешаны агитационными и информационными плакатами, повествующими об инфекционных заболеваниях.
Здоровый образ жизни, Профилактика вредных привычек, Анатомия и физиология человека, Личная гигиена и гигиена питания. Эти плакаты весьма поучительны. Две другие тематики, затронутые в экспозиции, - алкоголизм и курение. В стеклянных шкафах по обе стороны зала в заспиртованном виде храняться человеческие органы, пораженные спиртом и ядовитыми веществами сигарет. Седьмой зал Музея гигиены посвящен болезням, которыми всех нас ознакомляют еще со школьной скамьи: туберкулез, СПИД, наркомания. Представлены плакаты со способами заражения, методами профилактики. Здесь же для размещен информационный стенд "Пищевые отравления".

Не менее наглядно и изображение уродств и других последствий вредных привычек вроде курения, а также различных заболеваний. После таких, пожалуй и кошмары сниться начнут. Внутренние органы и скелеты также вызывают мало приятных ассоциаций. Однако не все экспонаты такие мрачные и страшные, попадаются и довольно забавные, вроде пластилиновых червячков на моделях зубов, а также грустные глаза самих зубов.

Посетители могут увидеть книги Сеченова, его бюст (опять же неизвестного автора и из непонятного материала), прочитать биографию ученого. Бюст Павлова аналогично безлик. На стене картина - "Павлов в операционной", отражающая всю важность и сосредоточенность врачей во время операции. Чем дальше от начала осмотра, тем экспозиционные залы меньше по своим размерам. Однако, экспонаты при этом становятся интереснее.